Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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BC048679D3YXE9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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BC048679D3YXE9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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BC048679D3YXE9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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BC048679D3YXE9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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BC048679D3YXE9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC048679D3YXE9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC048679D3YXE9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC048679D3YXE9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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BC048679D3YXE9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC048679D3YXE9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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BC048679D3YXE9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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BC048679D3YXE9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC048679D3YXE9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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BC048679D3YXE9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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