Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms