Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde4bB1AWC9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms