Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prr16A3KMN5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prr16A3KMN5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prr16A3KMN5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prr16A3KMN5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms