Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxl16A2RT62 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxl16A2RT62 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms