Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms