Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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