Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms