Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpc6Q9R087 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gpc6Q9R087 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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