Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11cQ9QZW0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms