Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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