Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tmod4Q9JLH8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tmod4Q9JLH8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tmod4Q9JLH8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tmod4Q9JLH8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tmod4Q9JLH8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tmod4Q9JLH8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmod4Q9JLH8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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