Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms