Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms