Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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