Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Bap18Q9DCT6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bap18Q9DCT6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Bap18Q9DCT6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Bap18Q9DCT6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Bap18Q9DCT6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Bap18Q9DCT6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Bap18Q9DCT6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Bap18Q9DCT6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Bap18Q9DCT6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Bap18Q9DCT6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms