Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms