Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hmg20aQ9DC33 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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