Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Swt1Q9DBQ9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Swt1Q9DBQ9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Swt1Q9DBQ9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Swt1Q9DBQ9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Swt1Q9DBQ9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Swt1Q9DBQ9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Swt1Q9DBQ9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Swt1Q9DBQ9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms