Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Abcg8Q9DBM0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms