Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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