Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms