Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a2Q9D8F3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc52a2Q9D8F3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms