Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4bQ9D8B3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms