Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp5Q9D7S9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms