Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1dQ9D4V4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms