Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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