Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms