Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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