Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms