Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms