Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms