Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms