Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fcf1Q9CTH6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fcf1Q9CTH6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fcf1Q9CTH6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fcf1Q9CTH6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fcf1Q9CTH6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Fcf1Q9CTH6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Fcf1Q9CTH6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Fcf1Q9CTH6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Fcf1Q9CTH6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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