Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms