Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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