Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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