Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Mrpl3Q99N95 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms