Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms