Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms