Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms