Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms