Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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