Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc4Q924T3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms