Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms