Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek8Q91ZR4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms