Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms