Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcaQ8VC88 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 414.8 ms