Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms