Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top1mtQ8R4U6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top1mtQ8R4U6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top1mtQ8R4U6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top1mtQ8R4U6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top1mtQ8R4U6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top1mtQ8R4U6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top1mtQ8R4U6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Top1mtQ8R4U6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Top1mtQ8R4U6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Top1mtQ8R4U6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Top1mtQ8R4U6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1mtQ8R4U6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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